办公室（党委办公室）

主要职责：承担机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作；统筹税收宣传工作；组织实施绩效管理；组织实施预决算、会计核算、财务内控和政府采购、资产管理等工作；负责机关后勤事务的管理、保障和服务工作。

法制科

主要职责：承担组织实施依法行政工作；承担涉及多个税种、社会保险费和有关非税收入综合性政策文件会办工作；承担规范性文件合法性审查等工作；承担重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税收案件审理；组织办理行政复议、行政赔偿行政诉讼等事项；承担单位内部控制工作、组织实施执法督察、监督检查、税收执法责任制工作；督促落实督察审计发现问题的整改工作。

纳税服务科

主要职责：组织开展本单位纳税服务（含缴费服务，下同）工作；组织实施纳税服务制度和规范；组织税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作；承担税收信用体系建设；承担落实涉税专业服务监管政策及制度，统筹协调纳税人（缴费人）需求收集、分析和应对；组织办理纳税服务投诉；承办12366转办工单；统筹税费服务任务；承担办税服务厅、办税延伸点、纳税服务热线等服务渠道一体化运行管理及服务效能评价与监测；承担各税种、社会保险费和非税收入征收服务工作；承担各类涉税涉费受理和办理。

组织人事科

主要职责：承担组织落实干部人事制度及税务人才队伍建设等工作；承担人事、机构编制、公务员管理、干部考核等工作；承担工资、人事档案、专业技术职务管理等工作；办理因公出国（境）政审和因私出国（境）管理事项；承担组织实施干部培训工作；承担老干部的服务和管理工作；承担党的组织建设、党员队伍建设等工作。

税政科

主要职责：承担组织实施各税种、社会保险费及非税收入的征收管理工作和落实优惠政策；承担相关税（费）种和进出口税收政策的解释和执行口径确定、日常管理、纳税辅导、咨询服务、税收法律救济、制定日常监管任务等任务;组织实施国家（地区）间税收条约（安排）、跨境税收管理工作、预约定价管理、反避税调查及风险应对工作、税收服务“一带一路”建设等工作；承担本单位外事管理。

征收管理科

主要职责：承担本单位税收、社会保险费和有关非税收入预算目标任务并依法组织实施；承担统筹协调组织收入工作，开展收入预测分析、预警分析和收入质量管理；承担本单位税收经济分析工作；承担组织落实综合性税收征管法律、法规、规章及规范性文件；组织实施税务登记、申报纳税、欠税（费）、普通发票、个体工商户等征管工作；承担各类税收征管信息系统业务维护工作。承担上级局下发风险应对任务的整合和推送；承担各类税收数据、社会保险费和有关非税收入数据的采集、分析应用、共享交换等事项。

税源管理一科

主要职责：承担辖区内大企业及重点税源企业的集中管理、集中风险应对；承担辖区内房地产开发企业土地增值税清算审核等工作；承担辖区内出口退税风险应对工作。

税源管理二科

主要职责：承担狮山街道、横塘街道辖区内纳税人（缴费人）的属地纳税服务、基础税（费）源管理和中低等风险应对工作。

税源管理三科

主要职责：承担枫桥街道辖区内纳税人（缴费人）的属地纳税服务、基础税（费）源管理和中低等风险应对工作。

税源管理四科

主要职责：承担浒墅关镇、浒墅关开发区、高新区综合保税区辖区内纳税人（缴费人）的属地纳税服务、基础税（费）源管理和中低等风险应对工作。

税源管理五科

主要职责：承担苏州科技城、东渚街道、镇湖街道以及通安街道辖区内纳税人（缴费人）的属地纳税服务、基础税（费）源管理和中低等风险应对工作。

机关党委（党建工作科）

主要职责：组织实施机关党建和党风廉政建设工作；统筹承担机关党员教育、管理、监督和服务工作；组织开展机关思想政治工作和精神文明建设；承担机关统战工作；协调机关工会、共青团、妇委会开展机关群团工作。

根据有关规定，设置党委纪检组，名称为“中共国家税务总局苏州高新技术产业开发区（苏州市虎丘区）税务局委员会纪律检查组”。负责内设机构和事业单位党的纪律检查工作。